MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium kluyveri DSM 555 plasmid pCKL555A

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009466	TTTA	2	8	51	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009466	CTT	2	6	90	95	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009466	ATA	2	6	101	106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009466	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_009466	TTA	2	6	139	144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_009466	ATA	2	6	178	183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009466	ACTA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_009466	T	6	6	195	200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009466	A	6	6	201	206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009466	ACGT	2	8	245	252	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_009466	AT	3	6	254	259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009466	TTA	2	6	267	272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009466	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009466	TA	4	8	283	290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009466	TA	4	8	293	300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009466	ATA	2	6	324	329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_009466	TAA	2	6	337	342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009466	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009466	TTA	2	6	371	376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009466	CAC	2	6	4006	4011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_009466	CTC	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009466	CTA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009466	CTT	2	6	5549	5554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009466	TAA	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009466	TTA	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009466	TAAT	2	8	5610	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009466	TTA	2	6	5701	5706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009466	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009466	CAA	2	6	6093	6098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009466	CATTAC	2	12	6114	6125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009466	CAA	2	6	6138	6143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_009466	T	8	8	6148	6155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009466	TAA	2	6	6179	6184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009466	ACC	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009466	TCATTT	2	12	6208	6219	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_009466	ATTCT	2	10	6235	6244	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_009466	TCT	2	6	6261	6266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009466	AC	3	6	6300	6305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009466	CCT	2	6	6325	6330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_009466	ACCC	2	8	6789	6796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_009466	TA	3	6	6800	6805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009466	TTC	2	6	7374	7379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_009466	CTA	2	6	7381	7386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009466	AAAT	2	8	7396	7403	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009466	ATTT	2	8	7424	7431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009466	AC	3	6	7435	7440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009466	TAA	2	6	7451	7456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009466	ATT	2	6	7844	7849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009466	AAT	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_009466	T	6	6	8383	8388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009466	CAT	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009466	ACC	2	6	9301	9306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009466	ATTT	2	8	14715	14722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009466	TGT	2	6	14730	14735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009466	ATTTT	2	10	14753	14762	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009466	T	6	6	17398	17403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009466	TTC	2	6	18202	18207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009466	CTT	2	6	18211	18216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009466	AAT	2	6	18230	18235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009466	AGT	2	6	18313	18318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009466	CTTT	2	8	18346	18353	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009466	CCT	2	6	18397	18402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_009466	CCCA	2	8	18407	18414	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_009466	TGCT	2	8	18425	18432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_009466	TCC	2	6	18600	18605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_009466	TGT	2	6	18695	18700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009466	A	6	6	18714	18719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009466	AGG	2	6	18743	18748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009466	TAT	2	6	18749	18754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009466	AATT	2	8	19170	19177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009466	ATC	2	6	19207	19212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_009466	TAA	2	6	19214	19219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009466	TAAT	2	8	19232	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009466	TAAT	2	8	19257	19264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009466	ATT	2	6	19274	19279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009466	AT	3	6	19280	19285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009466	TG	3	6	19286	19291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009466	T	6	6	19301	19306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009466	ATT	2	6	19311	19316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009466	TTAT	2	8	19319	19326	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009466	CA	4	8	19329	19336	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009466	T	7	7	19427	19433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009466	T	6	6	19451	19456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009466	TA	3	6	19471	19476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009466	TA	3	6	19478	19483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009466	A	7	7	19801	19807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009466	AT	3	6	19857	19862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009466	TAA	2	6	20255	20260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009466	T	6	6	20324	20329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009466	TG	3	6	21698	21703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009466	CT	3	6	21704	21709	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009466	A	6	6	22620	22625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009466	T	7	7	22668	22674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009466	ATC	2	6	22713	22718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009466	ATAGA	2	10	22743	22752	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009466	TA	3	6	22753	22758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009466	CTT	2	6	22769	22774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009466	GCA	2	6	22788	22793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009466	TGC	2	6	22818	22823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009466	T	6	6	22830	22835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009466	TA	4	8	22841	22848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009466	TAA	2	6	22875	22880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009466	TAT	2	6	22881	22886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009466	AAT	2	6	22934	22939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_009466	AT	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009466	TATAA	2	10	22965	22974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009466	CA	3	6	22982	22987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009466	TCC	2	6	23457	23462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_009466	ATA	2	6	23469	23474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009466	TA	3	6	23478	23483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009466	GTG	2	6	23492	23497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009466	TCC	2	6	23695	23700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_009466	ATTAT	2	10	23706	23715	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009466	AC	3	6	23727	23732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009466	TAA	2	6	23769	23774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009466	T	6	6	23775	23780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009466	CAT	2	6	23829	23834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009466	TA	3	6	23876	23881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009466	GA	3	6	23918	23923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009466	A	6	6	23946	23951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009466	TA	3	6	23968	23973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009466	TAA	2	6	23979	23984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009466	ATA	2	6	23988	23993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009466	TA	3	6	24387	24392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009466	TCC	2	6	24797	24802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_009466	AT	3	6	24807	24812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009466	A	6	6	24814	24819	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009466	TA	3	6	24915	24920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009466	ATT	2	6	25399	25404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009466	ACA	2	6	26623	26628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_009466	GTA	2	6	26644	26649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009466	T	6	6	26677	26682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009466	T	6	6	26735	26740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009466	TAAT	2	8	26744	26751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009466	TGA	2	6	26772	26777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009466	T	6	6	26784	26789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009466	TA	3	6	26811	26816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009466	GTT	2	6	26831	26836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009466	T	7	7	26835	26841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009466	TAC	2	6	26848	26853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_009466	AT	3	6	26900	26905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009466	A	7	7	26958	26964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009466	TA	4	8	26992	26999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009466	ATC	2	6	27734	27739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009466	ATTA	2	8	28694	28701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009466	TAA	2	6	28707	28712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009466	T	6	6	28736	28741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009466	TAA	3	9	28768	28776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009466	AAAT	2	8	28796	28803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009466	TA	3	6	28829	28834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009466	TAT	2	6	28840	28845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009466	AGG	2	6	28862	28867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009466	ATA	2	6	29487	29492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009466	TAA	2	6	29523	29528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009466	ACC	2	6	29973	29978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_009466	TA	4	8	29980	29987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009466	TAAT	2	8	29996	30003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009466	TA	3	6	30009	30014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009466	TA	3	6	30016	30021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009466	TTA	2	6	30081	30086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009466	TTTGC	2	10	30132	30141	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_009466	ATC	2	6	30183	30188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009466	GTA	2	6	30214	30219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009466	AATA	2	8	30230	30237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009466	T	6	6	30247	30252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_009466	ATTTT	2	10	30278	30287	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009466	TCC	2	6	31057	31062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_009466	A	6	6	31105	31110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_009466	TCC	2	6	31563	31568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_009466	A	6	6	31593	31598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_009466	A	6	6	31623	31628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_009466	ATT	2	6	31668	31673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_009466	CCT	2	6	33006	33011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_009466	A	7	7	33033	33039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_009466	CAT	3	9	33085	33093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_009466	TAACTT	2	12	33130	33141	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
177	NC_009466	CCTCA	2	10	33184	33193	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
178	NC_009466	TTA	2	6	33195	33200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_009466	A	6	6	33218	33223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_009466	CCT	2	6	46609	46614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
181	NC_009466	A	6	6	46629	46634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_009466	ATT	2	6	46660	46665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_009466	TTA	2	6	46666	46671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_009466	ATA	2	6	46759	46764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_009466	CAA	2	6	46765	46770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_009466	TA	3	6	46785	46790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009466	GTTTAA	2	12	46810	46821	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009466	ATT	2	6	46824	46829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009466	AT	3	6	47221	47226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009466	AT	3	6	47249	47254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009466	A	6	6	47267	47272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_009466	CTTCT	2	10	47292	47301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_009466	GTT	2	6	47359	47364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
194	NC_009466	TTC	2	6	47376	47381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
195	NC_009466	TGT	2	6	47397	47402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_009466	TAA	2	6	47408	47413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_009466	TAT	2	6	47817	47822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_009466	TTTAA	2	10	47824	47833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_009466	T	7	7	48789	48795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_009466	A	6	6	48804	48809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_009466	CCTC	2	8	49531	49538	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
202	NC_009466	TTG	2	6	50464	50469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
203	NC_009466	A	7	7	57125	57131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_009466	AGGG	2	8	57155	57162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_009466	TATT	2	8	57224	57231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_009466	ATT	2	6	57236	57241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_009466	CAC	2	6	57561	57566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
211	NC_009466	A	6	6	57583	57588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
212	NC_009466	ATT	2	6	58225	58230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_009466	AGT	2	6	59147	59152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
219	NC_009466	CTTT	2	8	59173	59180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.